Канакина родилась в 1995 году в Красноярске. В детстве Юлия занималась гимнастикой и балетом, но в 2011 году начала заниматься скелетоном. В этом же году начала выступать на международных соревнованиях, приняв участие в Юношеских Олимпийских играх.
В 2014 году Канакина начала выступать за сборную России на этапах Кубка мира. В 2017 году завоевала золото юниорского чемпионата мира, а через год — серебро на этом же турнире.
В 2022 году Юлия выступила на Олимпийских играх в Пекине, где заняла 11-е место.